Il processo di Digestione Anaerobica, ovvero in assenza di ossigeno libero, si basa sullo sviluppo di microorganismi che attaccano la sostanza organica trasformandola nel cosiddetto biogas, costituito da Biometano e Anidride Carbonica.
La sospensione organica proveniente dalla fase di pretrattamento è inviata in reattori chiusi detti digestori, alimentati in continuo e mantenuti in regime di termofilia.